A világjárvány kezdete óta a diagnosztikai vizsgálatok létfontosságú szerepet játszottak a SARS-CoV-2, a vírust okozó vírus terjedésének megfékezésében.COVID 19.Gyors antigén tesztekotthon vagy klinikai körülmények között végezve 15 perc alatt vagy kevesebb eredményt ad.Minél korábban diagnosztizálják az embert, annál hamarabb tud orvoshoz fordulni és elszigetelni magát másoktól.De amikor a vírus új változatai jelennek meg, előfordulhat, hogy ezeket a változatokat nem lehet kimutatni ezek a tesztek.
A legtöbb gyors antigéntesztet a SARS-CoV-2 nukleokapszid fehérje vagy N-protein kimutatására tervezték.Ez a fehérje bőségesen megtalálható a vírusrészecskékben és a fertőzött emberekben.Gyorsteszt készlets általában két különböző diagnosztikai antitestet tartalmaznak, amelyek az N fehérje különböző részeihez kötődnek.Amikor egy antitest kötődik a mintában lévő N-fehérjéhez, egy színes vonal vagy más jel jelenik meg a tesztkészleten, ami fertőzést jelez.
A Protein N 419 aminosav szerkezeti egységből áll.Ezek bármelyike ​​mutációval helyettesíthető másik aminosavval.A Ph.D. vezette kutatócsoportPhilip Frank és Eric Ortlund, az Emory Egyetem munkatársa arra vállalkozott, hogy megvizsgálja, hogyan befolyásolja ez az egyetlen aminosav változás egy gyors antigénteszt teljesítményét.A mélymutációs szkennelésnek nevezett technikát alkalmazták, hogy egyidejűleg felmérjék, hogy a vírus N-fehérjéjében lévő egyes mutációk hogyan befolyásolják a diagnosztikai antitestekhez való kötődést.Eredményeiket a Cellben tették közzé 2022. szeptember 15-én.
A kutatók közel 8000 N fehérjemutációt tartalmazó átfogó könyvtárat hoztak létre.Ezek a változatok az összes lehetséges mutáció több mint 99,5%-át teszik ki.Ezt követően kiértékelték, hogy az egyes változatok hogyan lépnek kölcsönhatásba 17 különböző diagnosztikai antitesttel, amelyeket 11 kereskedelmi forgalomban kapható gyors antigéntesztben használtak, beleértve a közös teszteket is.otthoni készletek.
A csapat felmérte, hogy mely N-protein mutációk befolyásolják az antitestek felismerését.Ezen információk alapján minden egyes diagnosztikai antitesthez létrehoztak egy „menekülési mutációs profilt”.Ez a profil azonosítja az N-fehérje specifikus mutációit, amelyek befolyásolhatják az antitest azon képességét, hogy kötődjön a célpontjához.Az elemzés kimutatta, hogy a mai gyorstesztekben használt antitestek felismerik és megkötik a SARS-CoV-2 minden korábbi és jelenlegi változatát, amely aggodalomra ad okot.
Bár számos diagnosztikai antitest felismeri az N-fehérje ugyanazt a régióját, a kutatók azt találták, hogy mindegyik antitest egyedi jele a szökési mutációknak.Mivel a SARS-CoV-2 vírus továbbra is mutálódik és új változatokat hoz létre, ezek az adatok felhasználhatók a tesztkészlet-ellenanyagok megjelölésére, amelyeket esetleg újra kell értékelni.
"A fertőzött egyének pontos és hatékony azonosítása továbbra is kritikus stratégia a COVID-19 mérséklésében, és tanulmányunk információkat nyújt a SARS-CoV-2 jövőbeni mutációiról, amelyek megzavarhatják a kimutatást" - mondta Ortlund."Az itt felvázolt eredmények lehetővé teszik számunkra, hogy gyorsan alkalmazkodjunk ehhez a vírushoz, miközben folyamatosan jelennek meg az új változatok, amelyek azonnali klinikai és közegészségügyi következményekkel járnak."
Háttér: A Mutation Deep Scan a jelenleg rendelkezésre álló gyors antigéntesztek segítségével észleli a menekülési mutációkat a SARS-CoV-2 nukleokapszidban.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022. szeptember 15.;185(19):3603-3616.e13.Belügyminisztérium: 10.1016/j.cell.2022.08.010.2022. augusztus 29. PMID: 36084631.
Finanszírozás: National Institute for Biomedical Imaging and Bioengineering NIH (NIBIB), National Institute of Diabetes, Digestive and Kidney Diseases (NIDDK) és National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), American Heart Association.
A NIH Research Matters az NIH szakértői által felülvizsgált kulcsfontosságú NIH kutatási eredmények heti frissítése.Kiadja az Országos Egészségügyi Intézetek Igazgatójának Kommunikációs és Közügyi Iroda.